Bu işlem için repeater'ın itemdatabound event'ını kullanabilirsin.
Seçilen dropdown'a göre işlem için de DropDownList'in SelectedIndexChange event'ını kullanabilirsin.
<asp:Repeater id="Repeater1" runat="server" OnItemDataBound="Repeater1_ItemDataBound">
<ItemTemplate>
<div>
<asp:DropDownList id="Dropdownlist" runat="server"></asp:DropDownList>
</div>
</ItemTemplate>
</asp:Repeater>
protected void Repeater1_ItemDataBound(object Sender, RepeaterItemEventArgs e)
{
// Eğer repeater'ı datatable ile dolduruyorsan DataRowView çok işini görebilir.
DataRowView drv = (DataRowView)e.Item.DataItem;
DropDownList list = (DropDownList)e.Item.FindControl("Dropdownlist");
// Veritabanından gerekli alanları çekip bind edebilirsin
list.DataSource = null;
list.DataBind();
}