Bu işlem için repeater'ın itemdatabound event'ını kullanabilirsin.
Seçilen dropdown'a göre işlem için de DropDownList'in SelectedIndexChange event'ını kullanabilirsin.

<asp:Repeater id="Repeater1" runat="server" OnItemDataBound="Repeater1_ItemDataBound">
	<ItemTemplate>
		<div>
			<asp:DropDownList id="Dropdownlist" runat="server"></asp:DropDownList>
		</div>
	</ItemTemplate>
</asp:Repeater>




protected void Repeater1_ItemDataBound(object Sender, RepeaterItemEventArgs e)
{
	// Eğer repeater'ı datatable ile dolduruyorsan DataRowView çok işini görebilir.
	DataRowView drv = (DataRowView)e.Item.DataItem;

	DropDownList list = (DropDownList)e.Item.FindControl("Dropdownlist");


	// Veritabanından gerekli alanları çekip bind edebilirsin
	list.DataSource = null;
	list.DataBind();

}