@anka81 hocam. Dediklerinizi gayet iyi anladım. jQuery ile AJAX işlemleri zaten yaptığım şey yabancı değilim. Fakat kodların içinde herhangi bir $.ajax gibi bir kod görmedim. O yüzden sorunu halledemedim şimdilik. Şuan dediklerinizden yola çıkarak tekrar denemeler yapıcam. Sorunu halledemezsem tekrar yardımınızı isterim hocam.
Alıntı
ayrıca senin yapmak istediğin sanırım sadece kullanıcının görselliği için. yani, php upload dosyan zaten replace ile adını değiştirip kaydediyorsa, herhangi bi tr karakter sorunun olmaz, kullanıcının gördüğü oradaki isim dosyası makyajlı olur sadece.
aynen de dediğiniz gibi hocam olayda

örneğin şakşuka.JPG diye bir dosyam var. PHP ile upload oluyor AJAX işlemi ile. ftp ye saksuka.jpg olarak kayıt oluyor. Ama Upload işlemi bitince javascript kodları dosya ismini aynen yazıyor. şakşuka.JPG şeklinde. benimde doğal olarak bunları replace etmem gerekiyor