1) Sitenin yedeğini alınız.
2) Ftp bilgilerini değiştiriniz
3) public_html veya httpdocs un içindeki herşeyi silip aldığınız yedeği tekrar yükleyin
4) Cuteftp kullanıyorsanız filezillaya geçiniz.
Sanırım yazdıklarım iframe virüsünden kurtulmana yarar