Bu cevap, konu sahibi tarafından kabul edilebilir bir cevap olarak işaretlendi.
Script değişimi yaptığınız zaman google'un tanıdığı tüm bilgiler de değişmiş oluyor. Tema değişimi çok dikkatli bir şekilde yapılmalıdır. İÇ SEO eski tasarımda ki düzenle aynı olduğu sürece pek sorun olmaz. Örnek veriyorum bir H etiketi bile değişse sıralamada düşüş illaki oluyor. Link yapınız değiştiyse buda bir gerilemeye hatta ceza almanıza bile sebep olabilir.
Title- Desc Değişimleri gibi değişikliklerde yapıldıysa bir süre beklemeniz gerekecek.