isset ve empty çok boyutlu dizilerde istenilen sonucu vermiyor, şunada bir göz atın.
function is_multiArrayEmpty($multiarray) {
    if(is_array($multiarray) and !empty($multiarray)){
        $tmp = array_shift($multiarray);
            if(!is_multiArrayEmpty($multiarray) or !is_multiArrayEmpty($tmp)){
                return false;
            }
            return true;
    }
    if(empty($multiarray)){
        return true;
    }
    return false;
}
http://php.net/manual/tr/function.empty.php