<?php
$sirano = 1; 
$query="SELECT soru,cevap from karne where username='$username' order by soru asc;";   
$result = mysql_query($query) or die(mysql_error());  

while($row = mysql_fetch_array($result))
{ 
$cevaplar.=$row['soru'].$row['cevap'].","; 
}
$kaydet=mysql_query("INSERT INTO sonuc (username,cevaplar) VALUES ('$username','$cevaplar');");

?>
Bu şekilde olması lazım. $cevaplar değişkenini diğerleriyle birleştirmediğin için en sonkini alıyor.
$cevaplar .= $row['soru'].$row['cevap'].",";