Abü sınır yok bildiğim kadarıyla. Fakat veritabanı sayısı önemsiz. İşlem kapasitesi önemli. 300 bin veritabanı da aktif olarak çalışırsa sık sık çöker o mysql. Kişisel fikrim böyle.
Gördüğüm bir örnekten bahsedicem;
Fazla site barındırmayan ortalama bir sunucuda (sunucu: AMD 2600+, 1024 mb ram) 50-60 tabloluk bir MYSQL, sitedeki online kişi sayısı ortalama 500-1000 arasyıken günde 3 defa sunucuyu kilitliyordu.
Biliyorsun ki sunucuyu en çok kasan şey sql.
Kişisel fikrim: Bence o kadar fazla sql açma.