$sehirler=array();
$sorgu=mysql_query("select * from users order by id asc");
while($veri=mysql_fetch_array($sorgu)) {
$sehir=$veri['sehir']
if($sehir=="")
$sehir="Bilinmeyen";
$sehirler[$sehir]=$sehirler[$sehir]+$veri['puan'];
}
mysql_free_result($sorgu);

dediğin zman sehirler diye bi dizi içine puanları atar diye düşünüyorum