<?
ob_start();
?>
<A onclick="MyWindow=window.open('pencere.php?link=17 8','Mywindow','toolbar=no,directories=no,top=100,l eft=100,status=no,scrollbars=yes,resizable=no,widt h=250,height=200');" href="#">asdasd</a>

<?
$source = ob_get_contents();
ob_end_clean();
$newsource = preg_replace('/<A onclick=(.*?) href="#">/i',"",$source);
echo $newsource;
?>

ob start ile denedim, oldu.
$newsource = preg_replace('/<A onclick=(.*?) href="#">/i',"",$source);
bu satırı senin satırınla değiştirsen sende de olur