<?php
$id = $_GET['id'];
echo $id;
?>

bunu

<SCRIPT>
var windowNesnesi
function yeni(){
windowNesnesi = window.open( "./ayrinti.php&id=<?php echo "$id"; ?>", "YeniPencere", "width=710, height=420, left=200, top=0, scrollbars=0, toolbar=0, menubar=0, location=1,directories=0,status=0")
}
</SCRIPT>

bunun üzerine mi yazmalıyım çünkü kalın yerle yazdığım yerde <? ?> kodunu hiç tanımıyor.

 <SCRIPT>
var windowNesnesi
function yeni(){
windowNesnesi = window.open( "./ayrinti.php&id=<?php $id = $_GET['id']; echo $id; ?>", "YeniPencere", "width=710, height=420, left=200, top=0, scrollbars=0, toolbar=0, menubar=0, location=1,directories=0,status=0")
}
</SCRIPT>

böyle yaptım üssteki ile aynı oldu

 http://localhost/site/ayrinti.php&id=