Safe mod açıkken bazı scriptlerde mysql sorguları çalışmıyor...O yüzden hata mesajları alabiliyorsunuz...
Bazı scriptler de kurulmak için iki modunda kapalı olmasını istiyor...

Diğer türlü(html,css) gibi sorun çıkardığını görmedim pek yine de uğraşan arkadaşlar daha iyi cevap verirler...