Hangi klasörün içini görecek dosya.portalmerkezi.net mi?
öyleyse;

<?php
    $direktory = "C:\Inetpub\vhosts\portalmerkezi.net\subdomains\dos ya\httpdocs";

    $handle=opendir($direktory);
    while ($file = readdir($handle)) {
          $filelist[] = $file;
    }
    asort($filelist);
    while (list ($a, $file) = each ($filelist)) {
          if ($file == "." || $file == ".." || $file == "index.html" || $file == "Thumbs.db") {
          } else {
       echo "<a href=\"$file\">$file</a><br>\n";
       //echo "$file<br>\n";
            }
    }
?>