sanırım bu htaccess ile ilgili olabilir yoksa wrapperda sorun çıkardığını ben işitmedim ancak olabilirde bir de bu htaccess ile denermisin kendi kullandığım
########## Buradan itibaren aşağıya kadar OpenSEF bileşeni için doğru kod başlangıcıdır
## OpenSEF bileşeniyle uyumlu çalışan kodlar aşağıda başlıyor
## Eğer hata alırsanız hemen aşağıdaki kodun başındaki + işaretini silin
Options +FollowSymLinks
## mod_rewrite in use
RewriteEngine On
## Eğer joomla sunucuda kök dizindeyse bir değişiklik yapmayın
## RewriteBase /
## Joomlanız alt dizinde kuruluysa aşağıya bu dizini belirtin yoksa dokunmayın
## RewriteBase /den sonra dizini yazın (sadece alt dizinde kuruluysa yoksa böylece bırakın
RewriteBase /
## Begin 3rd-Party or OpenSEF Section
#RewriteCond %{REQUEST_URI} ^(/component/option,com) [NC,OR] ##optional - see notes##
RewriteCond %{REQUEST_URI} (/|\.htm|\.php|\.html|/[^.]*)$ [NC]
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule (.*) index.php
## End 3rd-Party or OpenSEF Section