Yedek alırken Mysql 4.0 olarak yedek almayı deneyin.Ama hadi yaptınız çalıştı diyelim Windows destekli bir sunucu ile Joomla kullanımı zor olacaktır.Hatalar ile karşılaşmanız büyük olasılık.Sadece Unix destekli bir sunucuya geçmenizi öneririm.