<input type="checkbox" name="il[]" value="1">
<input type="checkbox" name="il[]" value="2">

 $ii=$_POST[il];
for($i=0;$i<count($il);$i++) {
if(!empty($ii[i])) {
query mi yapacaksın ekranamı yazdıracaksın artık o kısım
id yi 
echo $ii[$i];
mysql_query de ".$ii[$i]." gibi kullanabilirsin
}//if
}//for