Teşekkürler buraya sordukdan sonra cevap gelmeyince ben hallettim problemi.
Senin verdiğin kod da doğru ancak seo mantığına biraz ters olduğundan dolayı şu şekilde kullanılırsa daha iyi verim alınacaktır.

Alıntı
//'^tags\.php\?tag=(.-)$' => 'tags/$1/'