Ben son bilmem kaç saattir, silmenize gerek yok diyorum ve kimse de sormuyor nasıl olucak? Herkes niyet etmiş, illa ki silinecek diye...

Öncelikle arkadaşın istediği şey o menüde istediği kategoriyi gizlemek değil mi ?
Bunu illa ki o kategoriyi silerek yapamazsınız, öyle olsa, wp'nin ne güzelliği kaldı, yaptığınız seonun ne anlamı kaldı..?

Wp bunu düşünmüş ve exclude diye bir komut yapmış!
Hatta guzel pronun headerında şunu görürsünüz,

<div id="menux">
	<ul id="dmenu">
	<?php global $video; ?>
	<?php wp_list_categories('hide_empty=0&title_li=&exclude='.$video); ?>
	</ul>
	</div>

Siz bunu şu şekilde değiştiriceksiniz...
+ Öncelikle orada gösterilmesini istemediğiniz kategorinin id'sini öğreniyorsunuz...
+ Diyelim ki id'si 5 olsun:
Yukarıdaki kodu:

	<div id="menux">
	<ul id="dmenu">
	<?php global $video; ?>
	<?php wp_list_categories('hide_empty=0&title_li=&exclude='.$video.',5'); ?>
	</ul>
	</div>

şeklinde değiştirin. atıyorum, yok illa 3 id'li olan da gösterilmesin diyorsanız:

	<div id="menux">
	<ul id="dmenu">
	<?php global $video; ?>
	<?php wp_list_categories('hide_empty=0&title_li=&exclude='.$video.',5,3'); ?>
	</ul>
	</div>

şeklinde yazıyorsunuz... Ayrıca kategorilenmemişi;
WP-Admin / Ayarlar > Yazma > Varsayılan yazı kategorisi
bölümünden de değiştirebilir, daha sonra da silebilirsiniz...