ftp şifremi değiştirdim.
ftpden tüm dosyaları tekrar sildim, yenilerini attım. Çünkü bütün index.php lere bulaşıyor.
ftp programından kaynakladığını düşünmüyorum ayrı programı 1 senedir kullanıyorum ve 3-4 site de kullandım diğerlerinde sorun yok bir tek bunda var...

Bakalım şimdi yok bir şey 1-2 saat sonra çıkmaz inşallah bekliyorum...