Merhaba ;
sadece sorunuza değil genelde yaşanılan bir problem olduğu için geniş açıklamalı bir cevap vereceğim.
AWBS Yedeklerinizi Cpanel backup yada plesk backup programları ile alıp restore ederseniz sıkıntı yaşamazsınız .
El ile ftp backup , phpmyadmin Sql backup aldığınızda restore ederken sadece dosyaları ve sql'ı restore edersiniz . eğer sunucunuzu yeniden kurduysanız sıkıntıya yol açacaktır.
Sorunuzun cevabına gelince
FTP bağlantınızı binary modda yapıp dosyalarınızı atarsanız yukarıdaki hatayı almazsınız