index.php içeriğinde:

<?php if (have_posts()) : ?>
<?php while (have_posts()) : the_post(); ?>

satırları arasına;

<?php if(is_home()) {query_posts('cat=-3');} ?>

bu kodu ekleyin, ve anasayfada gösterilmeyecek kategori id'si kaçsa, kodda yazan 3 ile değiştirin.