PMA üzerinden dump ediyorsan bu tür sorunların çıkması kuvvetle muhtemel. En sağlıklı çözüm imkan varsa sunucu içinden mysqldump komutu ile yüklemendir. Bir diğer alternatif bigdump.php adındakı ufak faydalı araç. Bir başka alternatifte phpmyadmin'in epey eski sürümlerinden birini indirip eski sürüm üzerinden dump etmen.

Ek olarak, yedeklerini pma ile aldıysan yapacak birşey yok çünki pma yedek alırkende yüklerkende karakter setlerini bozuyor. Türkçe desteği vermeye çalışmışlar ama olmamış.