sunucunuzun, mysql optimizastonu için, tuning-primer.sh scriptini kullanmanızı tavsiye ederim..

ssh,tan wget ile scripti indireceğiniz adres
wget http://www.day32.com/MySQL/tuning-primer.sh

indirdikten sonra scripti chmod verin ve çalıştırın.;
chmod u+x tuning-primer.sh

./tuning-primer.sh

çıkan sonuçları buraya kopyalarsanız yardımcı olabilirim..