ayarlarda default index page gibi bişey var. orda index.php yazan yeri görürsün. index.php yazan yeri sil ve bişey yazma. sonra eski url'lerin hepsini sil. aynı sorun bende de vardı böyle hallettim. ama bunları yapmadan önce sef bileşeninin ve joomla sürümünün son sürüm olduğuna dikkat et.

Kolay gelsin.