virüs sunucu ile alakası yok bilgisayarınıza yerleşmesinden kaynaklanıyor ftp programlarınız baglandıgınız zaman index ile başlayan sayfalarınıza otomatıken yerleşiryor.
Arkadaşın dediği gibi öncelikle pc sağlam bir virus programı ile temizleyin öneri olarak kaspersk olabilir ondan sonra ftp dosyaları içindeki kodları tamizleyip yeniden atın tabi ftp şifrenizide değiştirin.