reklamın çıkmasını istediğin yere şunları yapıştır.

$uydur = rand(1,2);
if($uydur==1){
include("reklam1.php");
}else{
include("reklam2.php");
}

daha sonra reklam1.php ve reklam2.php diye iki dosya oluştur ikisine de değişik reklam kodlarını koy, ben denedim çalışıyor yapamazsan yardımcı olurum.