Onarım sırasında sunucu log tutuyor muhtemelen ve bu yüzden yükseliyor. Session yolunu değiştirerek hemen dolmasının önüne geçebilirsiniz.Arada birde yeni oluşturduğunuz session yolundaki logları silerseniz problem olmaz.
[Session]
; Handler used to store/retrieve data.
session.save_handler = files
php.ini içersindeki bu bölümdenmi bahsediyorsunuz.
bu arada şunu farkettim sadece onarma degil mysql yogun kullanıldıgı bir zaman tmp doluyor ssh'da sürekli df df df yazıyorum tmp dizini %45 % 30 %80 bole gidip gelio