Kendi düşüncem
1)Her zaman için cpanel veya mysqldumper kullanarak sql yedeği alırım
phpymyadmin ile birçok karakter sorunu yaşanıyor
aynı zamanda birçok sunucuda yükleme boyutu oldukça düşük tutuluyor
büyük boyutlu yedekleri yüklemek oldukça zorlaşıyor
phpmyadminden yüklenmediğinde bu seferde karakter sorunu oluşabiliyor
phpmyadmin veya panelden yüklemek yerine bigdump ve mysqldumper daha kolay ve sorunsuz diye düşünüyorum
Özetle yedek almak için mysqldumper+cpanel
yüklemek için mysqldumper+bigdump tavsiye ederim

2) normal durumlarda herhangi bir ayar yapman gerekmiyor

3) Alacağın yedek büyük boyutlarda ise gzip veya zip olarak alman daha mantıklı ve zaman kazandırır.