Wordpress Mu konusunda sanırım en tecrübeli kişi benim daha önce ingilizce Wordpress MU sitem vardı ve hiçbir sorunla karşılaşmadım. Script eklemeyi engellerseniz hiçkimse kod ekleyemez. Ayrıca Temalarda düzenlemeyi sadece siz yapabiliyorsunuz. Bu yönden kesinlikle sorunuz olmaz. Ancak Adsense başvurunu mutlaka siten aktif olduktan sonra MU'yu kuracan site için yap. Bu sayede incelenmeden geçmiş site olursun hemşerim dedigim gibi kesinlikle sorun olmaz ama MU spama yatkın bir sistem o yüzden denetlemesini iyi yapmanı tavsiyte ederim.