my.cnf için

wget http://www.day32.com/MySQL/tuning-primer.sh;chmod 755 tuning-primer.sh;sh tuning-primer.sh

komutunu çalıştırdıktan sonra çıkacak olan sonuçlar sizi doğru konfigürasyona götürecektir. kullanım miktarınıza göre ayar yapabilirsiniz. ayarlarda zorluk çekerseniz. çıktıyı buraya gönderin yardımcı olabilirim.
apache konfigürasyon ayarlarında da
KeepAliveTimeout 3
Timeout 60
olması idealdir. keepalivetimeout maximum 5 olsun.
servertokens ayarını
ServerTokens Prod
olarak değiştiriniz.