php izni dediğiniz sanırım iis ayar dosyalarından kaynaklanan bir problem.Basit Bir Düzenleme yapamadınızmı da bu kadar sıkıntı oldu.
Ayarlar kendi kendine bozulmaz Muhakkak bir etki vardır :P

Vps hizmeti durduk yere kesiliyorsa Sanet Sorumlu Buna tamam ama saldırı alan bir sistemde web sayfalarına erişim probleminin yaşanması normaldir.En azından Sisteminizin Donanımsal olarak da yüksek olmasını gerektirir.Cpu limitli bir vpsnin açık kalma şansı pek yok sanırım zaten

Sizin Konunuz Sadece Sizin Bilgi Eksikliğinizden Kaynaklanıyor.