godaddy Basehref belirtmek zorundasın çünkü her site için oto base oluşturmaktadır onların serveri.Yani güvenlik amaçlı.Onun için htaccess dosyasının rewrite yapmadan önce
Yaparsanız problem kalmaz.
Eger hala çalışmıyor ise scriptinde problem vardır

Htaccess dosyanızın düzenlenmiş hali bu şekilde oluyor..