sadece kodlamada farklılık gösterir.Yani google açısından değil de senin baktığın scriptin yapısı gereği değişiklilik arz eder.
www.a.com ve a.com arasında da zaten düşmüş domainler harici pek fark olmaz, pr sabittir yani.Eğer fark varsa o pr da düşecek demektir.Mesela benim sitemin pr'si hep aynıydı bi baktım güncellemede a.com pr3 e düşmüş
www.a.com pr4 . bir gün sonra ikisi de pr3 oldu.)