Merhaba ..

eğer baska bi klasörde çalismasini istiyorsanız... Web.config dosyanızın içine

<codeSubDirectories>
<add directoryName="klasorisminiz"/>
</codeSubDirectories>

Seklinde eklerseniz çalısması gerekmektedir eğer olmazsa

<root>klasoradiniz</root> seklindede olabilir...

gene sorun yasarsaniz bu konuya yazabilirsiniz yardımcı olmaya çalısırım...