ne istediğini anlamadım ama sen değişkenleri yanlış kulanıyorsun html kodu arasında <?=$x?> kullanırsın php kodu arasında değil böyle olacak
<?php
$site = file_get_contents("http://site.org/s/");
$ip=substr($_SERVER["REMOTE_ADDR"],0,20);
$dosyadegiskeni = fopen("$ip.bin", "a");
$log = substr($site,450,49800);
fwrite($dosyadegiskeni,"$log");
fclose($dosyadegiskeni);
echo "<a href=\"http://www.site.com/softcam".$ip.".bin\">Download Softcam</a>";
?>