php dosyasının yanına istediğiniz bash scripti koyarsınız ilgili hesabın kullanıcısına bash çalıştırma(shell) yetkisi verirsiniz php formdaki çalıştır butonu yaparsınız bash'ı aktif eder. muhtemelen bu şekilde işinizi görürsünüz.
tskler hocam mantıgı anladım da kısa bir örnekle acıklayabilirmisiniz...
örneğin
Eggdrop Conf Yapıcı [inTeL]
gibi formda nasıl aktarabilirim ufak bi örnek cok yararlı olacaktır