mod_rewrite için tabii ki script de değişiklik yapılması gerekir. şimdi baktım yapmışsın fakat bölümlere tıklayınca örneğin duyurulara;
http://www.hostmaster.gen.tr/bolum/1.0

404 error veriyor. gerekli eklentiyi tam olarak yapman gerek. bir yerlerde yanlışlık olmalı.