User-agent: *
Disallow: /*.php
Disallow: /*.pl
Disallow: /*.cgi
Disallow: /*.swf
Disallow: /*.iso
Disallow: /*.zip
Disallow: /*.exe

Robots.txt dosyasında hangi tür dosya indekslenmesi diyorsan o dosya türlerini bırakman yeterli olacaktır.