Web api yapıp exeyi apiye bağımlı hale getireceksin hocam , en fazla api linklerini ve çalışma mantığını çözebilirler ordada lisans kontrolleri ve güvenlik önlemleri alabilirsin en temizi bu sanırım kaynak koda gömünce dediğiniz gibi bir şekilde çıkarılıyor.