Merhaba,
Bu donanımla basit bir Python botunun sürekli kasması normal görünmüyor. Sorun sadece internet bağlantısından değil, VDS tarafındaki kaynak kullanımından da kaynaklanabilir.
Öncelikle CPU kullanımını, RAM tüketimini ve disk I/O değerlerini kontrol etmenizi öneririm. Özellikle VDS altyapısında aynı fiziksel sunucudaki yoğunluk nedeniyle CPU performansı düşebiliyor. E5-2699 v4 eski nesil bir işlemci olduğu için tek çekirdek performansı da güncel işlemcilere göre düşük kalabilir.
Eğer bot dış servislere sürekli istek atıyorsa ayrıca ping ve paket kaybını da kontrol etmek gerekir.
Kısaca: CPU/RAM kullanımı normalse ağ bağlantısına, ağ da normalse VDS üzerindeki CPU/disk performansına bakmak lazım.