Cloudflare direkt olarak sıralama kaybı yaşatmaz. Üst yorumdaki arkadaşın dediği gibi yanlış ayarlar yapmışsanız ondan kaynaklı sıralama kaybı yaşamış olabilirsiniz.
Sitenizin geç açılması direkt olarak sıralama kaybı sebebidir. Hatta sıralama kaybıyla beraber index silinmesi ve daha sonrasında index sorununu da beraberinde getirir.