Böyle bir şey olması için bir kaç problemin bir araya gelmesi gerekiyor aslında,
reboottan sonra otomatik başlar, fakat panelin çalıştığı portta başka bir şey start ediliyorsa backend-server çalışmayabilir.

şu komut ile servislerin durumunu görebilirsiniz.

/opt/panelica/bin/pn-status-detailed

şu komut ile restart deneyebilirsiniz.

/opt/panelica/bin/pn-service restart backend

tam emin olmak için logları incelemek gerekir.
eminim ki bizim hatamızdır, pm atıyorum dilerseniz destek sağlayalım hemen.