Brom senin verdiğin linkteki windows olan kısım için hatalı sıralama var. Doğrusu böyle olmalı en azından ben böyle çalıştırdım:

Github sayfasındaki kurulum talimatlarında çok sık yapılan bir hata yapılmış: [B]Windows kullanıcıları için de Mac/Linux kodları yazılmış.[/B] Sizin yaşadığınız sorunlar tam olarak bundan kaynaklanıyor!
Windows'ta komutlar biraz daha farklıdır. Örneğin Windows'ta python3 yerine sadece python yazılır ve source komutu çalışmaz.
Lütfen CMD veya PowerShell Siyah/Mavi ekranını açın ve [B]sırasıyla ve tek tek[/B] şu komutları kopyalayıp enter'a basın:
[B]1. İndirdiğimiz proje klasörünün içine girmek için:[/B]
cmd

cd C:\Users\Samet\.gemini\antigravity\scratch\scitara-main
[B]2. Sanal bir ortam oluşturmak için (Github'daki python3 kodunun doğrusu):[/B]
cmd

python -m venv venv
[B]3. O sanal ortamı aktif etmek için (Github'daki Linux kodunun Windows için doğrusu):[/B]
cmd

venv\Scripts\activate
[I](Bunu yazdığınızda komut satırının başında parantez içinde (venv) yazdığını görmelisiniz, bu aktifleşti anlamına gelir.)[/I]
[B]4. Gerekli kütüphaneleri (Excel indirme, veri çekme eklentileri vs.) kurmak için:[/B]
cmd

pip install -r requirements.txt
[B]5. Her şey hazır! Artık programı çalıştırmak için:[/B]
cmd

python scitara.py
Bu son koddan sonra siyah ekranda size hangi kelimeyi aratmak istediğinizi ve kaç makale indirmek istediğinizi soracaktır. Buradaki komutlarla sorunsuz olarak programı kullanabilirsiniz!

Bu arada veritabanın olarak sadece OpenAlex mi var seçme durumu olmuyor mu?