SQLite üzerinde VACUUM komutu ile boyut düşürebilirsiniz ama ne olur olmaz diye öncelikle yedek alınız.
Pek çok veri tabanında olduğu gibi önceden silinen kayıtlar gerçek anlamıyla SQLite'de silinmezler ayrıca veri tabanı yapısı zamanla karmaşıklaşır VACUUM yapılınca veritabanı baştan inşaa edilir.