derdini tam anlamadım, anladığım kadarıyla fikir vereyim.
dosya büyük, satır sütün, sayısı fazla diye dert ediyorsan phpspreadsheet de iterations var. iteration ile istediğin büyüklükte dosyayı dönebilirsin.
https://phpspreadsheet.readthedocs.i...sing-iterators
eğer yapıya uygunsa iterator ile döngüde verileri toplu bir şekilde hazırlarsın, en son update ve insert leri tek seferde halledebilirsin