Yapay zeka ile geliştiriyorsan <link rel="stylesheet" href="style.css"> gibi bir kod ekleyip, çakışmaya sebep olmuş olabilir. Problemli sayfada f12'ye bastığında ne görüyorsun? "Stiller" kısmında üzeri çizili kodlar var mı mesela?

Filezilla kullanıyorsan eğer, bazen upload'da sapıttığı oluyor. Programı kapatıp açıp, sorunlu dosyayı silmek, tekrar upload etmek problemini çözebilir belki.

Ek olarak .htaccess dosyanda, css için cache kodları olabilir. Şuna benzer:
# CSS ve JS
ExpiresByType text/css "access plus 1 month"
ExpiresByType application/javascript "access plus 1 month"
ExpiresByType text/javascript "access plus 1 month"