cloudflare taraflı whitelist durumu doğruysa, sunucu tarafında da ipleri allow edin, gerek iptables / firewalld / ufw (apache nginx conf lar dahil) ve mod_security taraflı da inceleyin. Ayrıca 500 dediniz, lisans çekiliyor mu ona bakın, error_log inceleyin, timeout artırın, network tarafında ayrı bir fw var mı ona baktırın vs ..