Bunun sebebi, tema ayarları ve css'i veritabanına farklı tablo ile işlemesi. Hali ile siz yedekleme aldığınızda bu tabloyu yedek almamış. Şimdi kullanmak istediğinizde ise tema configi yüklenmiyor. Aslında dosyalarınız eksiksizdir fakat temanın ayarlamasını tekrar yapmanız gerek.