sunucunuzda clamav varsa ise,
https://github.com/appwrite/php-clamav bunu kullanabilirsiniz.
eğer yüklenenler sadece görsel ise resize edebilirsiniz. orjinal boyutlarından %1 daha küçüğüne yeniden boyutlandırmadan sorunsuz geçiyorsa gerçek görsel dosyalarıdır.
bunun dışında yüklediğiniz dosyalar public olarak erişebilir değilse problem olmaz.