Söylediğiniz gibi search console verisi sadece google'dan gelen organik trafiği temsil etmektedir. Analytics'te ise bot trafik dahil her türlü kaynağın toplamını izleyebilirsiniz.
Site bana ait olduğu için bot kısmını elemiştim bunu elememdeki diğer faktör ise verilerin her ay böyle olması yani birisi bot attıysa her ay atmaz diye düşündüm.
6 aydır Search console ve Analytics verileri arasında gelen organik trafikte 50-60K fark oluyor.